Imaris : Visualisation et analyse d’images 3D

• Découvrir les possibilités du logiciel en traitement et d’analyse d’images 3D Imaris
• Acquérir les bases du traitement et de l’analyse des images 3D numériques en biologie

Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Doctorants

• Traitement images
• Analyse d’images

• Évaluation de satisfaction
• Contrôle de connaissance
• Attestation de fin de formation

• Experts en imagerie photonique

• Introduction à l’image numérique 2D et 3D : Image matricielle ou vectorielle.
• Présentation d’Imaris et ses fonctionnalités.
• Découverte de l’interface du logiciel et manipulations d’images simples.
• Outils de visualisation 2D/3D: Slices,Section,Ortho/oblique slicers, clipping plane, etc…
• Module Measurement
• Introduction au traitement d’images: filtrage, correction de fond, etc…
• Imaris3D View et MeasurementPro
• Modules Surfaces et Spots
• Extraction de données : Snapshots et création d’animations complexes
  • Et en fonction des besoins des participants (facultatif)
• ModuleTrack : Suivi d’objets 3D+temps automatique, édition et révision des tracks
• Module Filament Tracer (réseaux vasculaires ou neuronaux)
• Imaris Cell : segmentation cellulaire et intra–cellulaire
• Imaris Vantage : création de graphiques
• Imaris XT : Interface Fiji
• Imaris Coloc : isolement, visualisation, et quantification de la colocalisation en 3D, 3D/temps

• Apports théoriques
• Travaux pratiques – la formation se fera sur la base des images qui auront été préalablement envoyées par les participants afin de tester le logiciel sur des problématiques précises.